北京市营养源研究所始建于1977年，直属于北京市科学技术研究院，是目前国内唯一一家以营养资源为研究对象的多学科、综合性应用技术研究所。2000年,北京市营养源研究所由事业单位转制为全民所有制的科技型企业，注册资金1027万元，子公司8家，其中高新技术企业3家。2011年北京市营养源研究所被北京市科学技术委员会认定为北京科技研究开发机构。现任所长是高宝华高级工程师。
截止2011年末，北京市营养源研究所及所属公司共有员工348名，中高级职称以上专家80多名；其中：2人享受国务院特殊津贴，1人入选北京市新世纪百千万人才工程，5人入选北京市优秀人才计划，5人获得北京市科技新星计划资助，24入选北京市科学技术研究院萌芽计划，8人获得北京市科学技术研究院青年骨干资助，在站博士后5人。成立以来，累计完成国家、部市级科研成果100多项，获各级科研成果奖18项，取得发明专利40余项，技术成果转让合同项目600余项。科研成果在所属公司实现产业化项目20余项，产品销售额已超过6亿元。